La iglesia de San Sebastián acoge desde el año 2013 las Jornadas de Música en el Patrimonio Rehabilitado, una iniciativa con la que el Consorcio de Toledo pretende combinar la recuperación del patrimonio y su conservación con el desarrollo y potenciación de actividades culturales vinculadas a la ciudad.
Gracias a estas jornadas se celebran una serie de conciertos de música de cámara protagonizados por jóvenes artistas con los que el Consorcio de la Ciudad de Toledo también ofrece una oportunidad a estos artistas noveles de demostrar sus capacidades musicales.
La iglesia de San Sebastián, donde se celebran estas citas musicales desde hace casi una década, es uno de los ejemplos de la rehabilitación integral de importantes monumentos que lleva a cabo el Consorcio de Toledo en esta ciudad Patrimonio de la Humanidad.